ВИЧ остается одним из самых изученных вирусов, но при этом многие детали его взаимодействия с клетками человека до сих пор оставались скрытыми. Известно, что вирус использует всего девять собственных генов, чтобы захватить сложную клеточную систему человека, однако какие именно гены хозяина определяют успех заражения долгое время было загадкой.

Команда американских исследователей решала эти проблемы с помощью создания масштабной карты генетических взаимодействий ВИЧ в реальных человеческих клетках. Ученые работали с CD4+ T-клетками — основными мишенями вируса, что позволило получить более точную картину происходящего в организме. Выводы исследования опубликованы на сайте Института Гладстона.

С помощью CRISPR проверили около 20 тысяч человеческих генов. В результате ученые обнаружили сотни белков, влияющих на инфекцию. Одни из них используются вирусом для проникновения и размножения, а другие, наоборот, подавляют его активность.

Наиболее важными оказались два белка: PI16 и PPID. PI16 действует на самой ранней стадии и фактически блокирует заражение еще до его начала. PPID работает позже: он мешает вирусу добраться до ядра клетки и начать копирование своей ДНК.

Затем эффективность белков проверили на агрессивных штаммах ВИЧ: повышение уровня PI16 и PPID заметно снижало инфицирование. В дальнейших экспериментах исследователям удалось усилить антивирусное действие PPID примерно в десять раз.

«Мы обнаружили природные противовирусные белки, которые ранее были невидимы, потому что вирус мог эффективно подавлять их. Увеличив уровень этих генов в Т-клетках, мы, наконец, смогли увидеть, как они одерживают победу над ВИЧ», — прокомментировал соавтор работы Эли Дуган. Пока ученые продолжают доклинический этап экспериментов, тестируя различные терапевтические подходы.

Ранее другие ученые показали возможность контроля ВИЧ без лекарств с помощью иммунотерапии: пациентам удалось добиться длительного контроля над вирусом спустя многие месяцы после прекращения лечения.