Проект «федеральных университетов» сулит СПбГУ и МГУ не только удвоенное финансирование и большую самостоятельность, но и федеральных назначенцев. Отмена выборности ректоров федеральных университетов — основное предварительное условие правительства, готового поддержать проект. Для Людмилы Вербицкой, которая уже пересиживает на посту ректора несколько месяцев, это может означать скорую отставку, ибо её наиболее вероятный преемник пользуется серьезной поддержкой высокопоставленных друзей из Москвы. А отставка Вербицкой, в свою очередь, не устраивает губернатора Петербурга Валентину Матвиенко.