Энтерогеморрагические эшерихии выделяют цитотоксин, вызывающий гибель клеток Hela и Vero in vitro. Кроме того они продуцируют шигаподобный токсин 1 (веротоксин 1), аналогичный токсину Shigella dysenteriae типа 1 и шигаподобный токсин (веротоксин 2). Геном EHEC содержит плазмиды, кодирующие образование фимбрий, облегчающих адгезию бактерий на эпителии кишечника и ген eae, кодирующий синтез продуктов, изменяющих структуру слизистой оболочки (В.И.Покровский академик РАМН).